Stephen Kr?mer
| Telefon: | (+49) 0821 - 598 - 5922 |
| E-Mail: | stephen.kraemer@uni-auni-a.de () |
| Raum: | 9002 (BCM) |
| Sprechzeiten: | nach Vereinbarung |
| Adresse: | Alter Postweg 101 (Büro Center Messe), 86159 Augsburg |
RESEARCH INTERESTS
- molecular mechanisms of epigenetic programming
- epigenetic control of differentiation in health and disease
- statistical testing and modeling for multi-omics data
- performant NGS data processing
SELECTED PUBLICATIONS
Melinda Czeh, Sina St?ble, Stephen Kr?mer, Lena Tepe, Sweta Talyan, Joana Carrelha, Yiran Meng, Barbara Heitplatz, Marius Schwabenland, Michael D.?Milsom, Christoph Plass, Marco?Prinz, Matthias Schlesner, Miguel A.?Andrade-Navarro, Claus Nerlov, Sten Eiric W.?Jacobsen, Daniel B. Lipka?and Frank Rosenbauer. 2022. DNMT1 deficiency impacts on plasmacytoid dendritic cells in homeostasis and autoimmune Disease. The Journal of Immunology 208, 2, 358–370.
DOI: 10.4049/jimmunol.2100624
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Marina Scheller, Anne Kathrin Ludwig, Stefanie G?llner, Christian Rohde, Stephen Kr?mer, Sina?St?ble, Maike Janssen, James-Arne?Müller, Lixiazi He, Nicole B?umer, Christian?Arnold, Joachim?Ger?, Maximilian?Sch?nung, Christian Thiede, Christian?Niederwieser, Dietger Niederwieser, Hubert Serve, Wolfgang E. Berdel, Ulrich Thiem, Inga Hemmerling, Florian Leuschner, Christoph Plass, Matthias Schlesner, Judith Zaugg, Michael D.?Milsom, Andreas Trumpp, Caroline?Pabst, Daniel B.?Lipka?and Carsten Müller-Tidow. 2021. Hotspot DNMT3A mutations in clonal hematopoiesis and acute myeloid leukemia sensitize cells to azacytidine via viral mimicry response. Nature Cancer 2, 5,?527–544. DOI: 10.1038/s43018-021-00213-9
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Ani Grigoryan, Johannes?Pospiech, Stephen?Kr?mer, Daniel Lipka, Thomas?Liehr, Hartmut?Geiger, Hiroshi?Kimura, Medhanie A.?Mulaw?and? Maria C. Florian. 2021. Attrition of X Chromosome Inactivation in Aged Hematopoietic Stem Cells. Stem Cell Reports 16, 4,?708–716.
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Daniel Hübschmann, Lea?Jopp‐Saile, Carolin Andresen, Stephen Kr?mer, Zuguang Gu, Christoph E. Heilig, Simon Kreutzfeldt, Veronica Teleanu, Stefan Fr?hling, Roland?Eils?and Matthias Schlesner. 2020. Analysis of mutational signatures with yet another package for signature analysis. Genes, Chromosomes and Cancer 60, 5,?314–331. DOI: 10.1002/gcc.22918
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LECTURES AND COURSES
SUMMER SEMESTER 2024
- Bioinformatik 2 (Vorlesung)
- Bioinformatische Analysen (Vorlesung)
- Current Topics in Medical Information Sciences (Kolloquium)
- Biomedizinische Informatik (MA-Praktikum)
- Biomedical analysis of single cell data (Praktikum)
- Bioinformatik 2 (?bung)
- Bioinformatische Analysen (?bung)
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WINTER SEMESTER 2023/24
- Bioinformatik 1 (Vorlesung)
- Bioinformatische Analysen (Vorlesung)
- Current Topics in Medical Information Sciences (Kolloquium)
- Einführung in Data Science und Data Engineering (Vorlesung)
- Medizinisches und Naturwissenschaftliches Grundlagenseminar (Vorlesung)
- Biomedizinische Informatik (MA-Praktikum)
- Biomedizinische Informatik (BA-Seminar)
- Biomedizinische Informatik (MA-Seminar)
- Bioinformatik 1 (?bung)
- Bioinformatische Analysen (?bung)
- Einführung in Data Science und Data Engineering (?bung)
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SUMMER SEMESTER 2023
- Bioinformatik 2 (Vorlesung)
- Biomedizinische Informatik (MA-Praktikum)
- Biomedical analysis of single cell data (Praktikum)
- Biomedizinische Informatik (BA-Seminar)
- Biomedizinische Informatik (MA-Seminar)
- Bioinformatik 2 (?bung)
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WINTER SEMESTER 2022/23
- Bioinformatik 1 (Vorlesung)
- Bioinformatische Analysen (Vorlesung)
- Einführung in Data Science und Data Engineering (Vorlesung)
- Klinisches Anwendungsprojekt - Schlesnerlab (?bung)
- Biomedizinische Informatik (MA-Praktikum)
- Biomedizinische Informatik (BA-Seminar)
- Biomedizinische Informatik (MA-Seminar)
- Einführung Data Sciene (?bung)
- Bioinformatik 1 (?bung)
- Bioinformatische Analysen (?bung)
- Einführung in Data Science und Data Engineering (?bung)
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SUMMER SEMESTER 2022
- Bioinformatik 2 (Vorlesung)
- Grundlagen der biomedizinischen Informatik (Vorlesung)
- Biomedizinische Informatik (MA-Praktikum)
- Biomedical analysis of single cell data (Praktikum)
- Biomedizinische Informatik (BA-Seminar)
- Biomedizinische Informatik (MA-Seminar)
- Bioinformatik 2 (?bung)
- Grundlagen der biomedizinischen Informatik (?bung)
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WINTER SEMESTER 2021/22
- Bioinformatik 1 (Vorlesung)
- Bioinformatische Analysen (Vorlesung)
- Klinisches Anwendungsprojekt - Schlesnerlab (?bung)
- Biomedizinische Informatik (MA-Praktikum)
- Biomedizinische Informatik (BA-Seminar)
- Biomedizinische Informatik (MA-Seminar)
- Bioinformatik 1 (?bung)
- Bioinformatische Analysen (?bung)
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SUMMER SEMESTER 2021
- Grundlagen der biomedizinischen Informatik (Vorlesung)
- Klinisches Anwendungsprojekt (Praktikum)
- Biomedical analysis of single cell data (Praktikum)
- Biomedizinische Informatik (BA-Seminar)
- Grundlagen der biomedizinischen Informatik (?bung)
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WINTER SEMESTER 2020/21
- Grundlagen der biomedizinischen Informatik (Vorlesung)
- Biomedical Data Analysis (Praktikum)
- Biomedizinische Informatik (BA-Seminar)
- Grundlagen der biomedizinischen Informatik (?bung)